《太空部队》第 2 季讲述了内尔德将军和他不被看好的团队在应对人际难题的同时，不得不向新政府证明自己的价值。在重重压力下，这个团队会团结一心还是会分崩离析？毕竟太空部队也只是人类而已。

某晚，中央城爆发激战，闪电侠巴里·艾伦（贾斯汀·钱伯斯 Justin Chambers 配音）和超人、蝙蝠侠、戴安娜、绿灯侠等正义联盟的伙伴们与来自25世纪的急速教授及其爪牙镜子大师、陀螺、速冻队长你来我往，最终将这群恶棍绳之于法。分别时刻，急速教授的一番话触动巴里心底最敏感的地方。在此之后，似乎一切都发生变化。他一觉醒来，发现无赖帮们继续为非作歹，自己则意外丧失了变身闪电侠的能力，更令他出乎意料的是本应在童年被盗贼杀害的母亲竟然活着出现在他面前。全世界仿佛也天翻地覆，戴安娜率领的亚马逊人以及亚特兰蒂斯阴谋毁灭世界，布鲁斯死去，他的父亲托马斯·韦恩则以粗暴的蝙蝠侠身份出现。
从未存在过的正义联盟，世界灭亡的前夕…… 

一艘太空巡洋舰坠毁在了黑纳斯星球上，这是一个关押着整个银河系中最邪恶危险罪犯的星际监狱。大部分队员都在这场事故中遇难，全队只剩下飞船的驾驶员——星际英雄马克斯·克劳德，倒霉的厨师杰克和极不配合的指挥官雷克西。他们的任务很简单，那就是等待救援人员的到来，同时尽自己最大的努力阻止监狱中的囚犯登船，然而这可是马克斯·克劳德，他总有办法把事情复杂化。